برزت فكرة إنشاء مركز الأمم المتحدة للتدريب والتوثيق في مجال حقوق الإنسان لجنوب غرب آسيا والمنطقة العربية، في إطار اللقاء الإقليمي الثاني عشر لمنطقة آسيا والخاص بتعزيز وحماية حقوق الإنسان، والذي عُقد في قطر في آذار/مارس من العام 2004. رحّبت لجنة حقوق الإنسان في الأمم المتحدة في العام 2005 بفكرة إنشاء المركز، وفي خطوة لاحقة أصدرت الجمعية العامة للأمم المتحدة القرار رقم 153/60 بتبنّي فكرة تأسيسه، ورحّبت أيضاً بمبادرة دولة قطر لاستضافته، بحيث يعمل تحت الإشراف المباشر لمفوضية الأمم المتحدة السامية لحقوق الإنسان. وأشار القرار أيضاً إلى تفويض المركز بتنظيم أنشطة للتدريب والتوثيق في مجال حقوق الإنسان وفقاً للمعايير الدولية لحقوق الإنسان، وكذلك دعم الجهود لحماية وتعزيز ونشر ثقافة حقوق الإنسان في الإقليم، بالتعاون مع الحكومات، ووكالات وبرامج الأمم المتحدة المتخصصة، والمؤسسات الوطنية لحقوق الإنسان، والمنظمات غير الحكومية. واستكمالاً لإجراءات التأسيس، وقّع مكتب مفوضية الأمم المتحدة السامية لحقوق الإنسان مع دولة قطر اتفاقية المقر في كانون الأول/ديسمبر 2008، وتم افتتاح المركز رسمياً من قبل مفوض الأمم المتحدة السامي لحقوق الإنسان في أيار/مايو 2009 في الدوحة، قطر.